微生物
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微生物生长曲线
从 OD600 到生长参数、残差和可比较的批次曲线。
四参数 Logistic/Gompertz 非线性拟合；区间来自局部协方差近似。OD 未自动换算菌体数量。
多样性与稀释曲线
计算样本多样性，并通过重复抽样比较测序深度。
输入非负整数计数；不支持相对丰度冒充计数。稀释为不放回抽样，固定随机种子可复现。
群落 PCoA 分析
从距离矩阵观察群落关系，并检验指定分组。
Bray–Curtis 或 Jaccard；经典 PCoA，报告负特征值；可选 PERMANOVA，不自动检查组内离散度差异。
Monod 底物限制生长
计算限制性底物浓度对应的比生长速率。
单底物经验模型，无底物抑制与产物抑制。
指数生长与倍增时间
从起止数量和间隔时间估算比生长速率及指数轨迹。
稳定指数生长阶段，输入起止数值必须为正。
菌落计数浓度
按涂布体积和稀释比例换算 CFU/mL。
单平板点估计；菌团、活菌可培养性与计数范围影响解释。
热灭活 D/z 模型
按温度、D 值和 z 值估算对数存活下降。
等温一阶 log-linear 模型，不含肩部、拖尾和热传递；不用于灭菌工艺放行。
生物量底物得率
由生物量增加与底物消耗计算表观得率。
批次表观得率，不扣除维持代谢或副产物。
批次培养底物耦合
联立底物消耗与生物量增长模拟批次培养。
恒定得率、无死亡和维持代谢，单底物 Monod。
恒化器稳态与洗出
绘制稀释率对稳态底物和生物量的影响。
理想全混流、无死亡和维持代谢，单底物 Monod。
微生物世代数
n=log₂(N/N₀)：根据输入计算微生物世代数，提供局部敏感性曲线与数据导出。
理想二分裂等效世代数，减少时为负值。
两点比生长速率
μ=ln(X₂/X₁)/Δt：根据输入计算两点比生长速率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
两点间近似指数变化；不能定位迟缓期或估计置信区间。
指数生物量预测
X=X₀exp(μt)：根据输入计算指数生物量预测，提供局部敏感性曲线与数据导出。
短时无限制指数阶段，超出数值范围会拒绝结果。
逻辑斯谛生物量预测
X=K/[1+(K/X₀−1)e^(−rt)]：根据输入计算逻辑斯谛生物量预测，提供局部敏感性曲线与数据导出。
给定参数的经验模型，不进行观测拟合。
逐级稀释总倍数
D=stepⁿ：根据输入计算逐级稀释总倍数，提供局部敏感性曲线与数据导出。
等倍体积稀释；级数须为整数。
OD 与干重换算
X=a·OD+b：根据输入计算OD 与干重换算，提供局部敏感性曲线与数据导出。
定标参数依菌株、仪器与光程，需处于线性测量范围。
微生物对数减少
LR=log₁₀(N₀/N)：根据输入计算微生物对数减少，提供局部敏感性曲线与数据导出。
正存活数；未检出不应直接代入零。
存活分数
S=N/N₀：根据输入计算存活分数，提供局部敏感性曲线与数据导出。
仅为计数比，不自动解释为处理效果或校正背景。
D 值灭活时间
t=D·log₁₀(N₀/N)：根据输入计算D 值灭活时间，提供局部敏感性曲线与数据导出。
给定温度下一级灭活模型；不作为工艺验证或灭菌保证。
D 值温度修正
D(T)=Dref·10^[(Tref−T)/z]：根据输入计算D 值温度修正，提供局部敏感性曲线与数据导出。
经验线性 logD–T 区间；不能跨材料任意外推。
等温等效致死量
F=t·10^[(T−Tref)/z]：根据输入计算等温等效致死量，提供局部敏感性曲线与数据导出。
均匀恒温的等效时间，不包含升降温段或冷点验证。
目标生长率所需底物
S=Ks μ/(μmax−μ)：根据输入计算目标生长率所需底物，提供局部敏感性曲线与数据导出。
单一限制性底物 Monod 模型，目标生长率须低于上限。
Pirt 底物消耗
qs=μ/Y+m：根据输入计算Pirt 底物消耗，提供局部敏感性曲线与数据导出。
生长与维持底物需求的线性经验分解。
氧传递速率
OTR=kLa(C*−CL)：根据输入计算氧传递速率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
充分混合液相；负值表示净脱氧方向。
体积耗氧速率
OUR=qO₂X：根据输入计算体积耗氧速率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
比速率按干重基准并与实际培养条件一致。
恒化器稀释率
D=F/V：根据输入计算恒化器稀释率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
等体积进出液；不能单凭稀释率判定是否发生洗出。
细胞体积生产率
Px=DX：根据输入计算细胞体积生产率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
稳态连续培养，无细胞回流。
接种体积物料衡算
Vin=Vfinal Xtarget/Xseed：根据输入计算接种体积物料衡算，提供局部敏感性曲线与数据导出。
均匀混合且无即时损失；只是质量平衡，不涉及培养操作条件。
计数泊松零检出概率
P(0)=exp(−cV)：根据输入计算计数泊松零检出概率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
独立均匀分布的泊松取样，不适用于明显团聚。
取样至少一次检出率
P(≥1)=1−exp(−cV)：根据输入计算取样至少一次检出率，提供局部敏感性曲线与数据导出。
理想泊松取样与百分之百检出效率；实际检出还取决于方法回收率。
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