生物化学
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酶动力学拟合
拟合米氏动力学和抑制模型,比较实验与预测。
底物、抑制剂浓度使用同一单位;抑制模型需要多个抑制剂浓度。局部线性化参数区间不替代实验设计。

代谢通路编辑
编辑节点和反应连接,将自己的表达数据映射到通路。
自定义网络,不内置受限的 KEGG 数据;表达量颜色不表示真实通量。JSON 可编辑并保存。

反应网络动力学
模拟质量作用动力学,比较参数变化与系统响应。
正向质量作用模型;化学计量由用户指定,不接受任意 Python 表达式。敏感性为指定速率常数的有限扰动。

缓冲液 pH 与酸碱比
根据弱酸 pKa 与共轭酸碱浓度估算 pH。
活度以浓度近似,缓冲范围附近适用。

母液稀释与配液
按浓度守恒计算母液和稀释剂体积。
体积可加、无反应和浓缩过程。

吸光度与浓度换算
用摩尔吸光系数和光程计算浓度。
稀溶液、单色光、已扣空白且低散射;非线性需校准。

反应速率温度缩放
以参考速率和活化能预测温度变化下的速率常数。
同一反应机制、活化能恒定,仅在已验证温区应用。

自由能与平衡常数
关联标准自由能变化和无量纲平衡常数。
标准态定义一致,热力学活度平衡;不是动力学速率预测。

Hill 配体结合
用协同系数绘制配体结合占有率。
经验占有模型,Hill 系数不能直接视为位点数。

竞争性酶抑制
比较有无抑制剂时的底物初速曲线。
简单可逆竞争性抑制、初速与准稳态,Vmax 不变。

配液质量换算
m=CVM:根据输入计算配液质量换算,提供局部敏感性曲线与数据导出。
按纯溶质质量计算;水合物、纯度及吸湿需另行修正。

质量浓度转摩尔浓度
C=ρmass/M:根据输入计算质量浓度转摩尔浓度,提供局部敏感性曲线与数据导出。
摩尔质量需与实际化学形态一致。

母液取用体积
Vstock=Cfinal Vfinal/Cstock:根据输入计算母液取用体积,提供局部敏感性曲线与数据导出。
按最终定容体积,不假定混合体积严格相加。

透射率转吸光度
A=−log₁₀T:根据输入计算透射率转吸光度,提供局部敏感性曲线与数据导出。
以分数输入透射率,需要匹配参比与波长。

吸光度定量
c=A/(εl):根据输入计算吸光度定量,提供局部敏感性曲线与数据导出。
比尔朗伯线性范围、无散射与基质干扰。

氢离子浓度估算 pH
pH≈−log₁₀[H⁺]:根据输入计算氢离子浓度估算 pH,提供局部敏感性曲线与数据导出。
稀溶液活度系数取一;严格 pH 定义基于活度。

pH 转氢离子浓度
[H⁺]≈10^(−pH):根据输入计算pH 转氢离子浓度,提供局部敏感性曲线与数据导出。
稀溶液近似,不含活度系数。

缓冲液碱酸比例
[A⁻]/[HA]=10^(pH−pKa):根据输入计算缓冲液碱酸比例,提供局部敏感性曲线与数据导出。
Henderson–Hasselbalch 近似,浓度代替活度。

弱酸缓冲容量
β=ln10·C Ka[H⁺]/(Ka+[H⁺])²:根据输入计算弱酸缓冲容量,提供局部敏感性曲线与数据导出。
仅缓冲对贡献,忽略水自解离、活度与多质子耦合。

弱酸解离比例
f=1/[1+10^(pKa−pH)]:根据输入计算弱酸解离比例,提供局部敏感性曲线与数据导出。
单质子弱酸平衡;并非跨膜通透性或药效预测。

酶周转数
kcat=Vmax/[E]total:根据输入计算酶周转数,提供局部敏感性曲线与数据导出。
Vmax 与活性位点浓度需同一体积基准。

酶催化效率
η=kcat/Km:根据输入计算酶催化效率,提供局部敏感性曲线与数据导出。
低底物近似的二级效率参数,不等于扩散常数。

竞争抑制表观 Km
Kmapp=Km(1+I/Ki):根据输入计算竞争抑制表观 Km,提供局部敏感性曲线与数据导出。
快速平衡可逆竞争抑制,Vmax 不变。

Cheng–Prusoff Ki
Ki=IC50/(1+S/Km):根据输入计算Cheng–Prusoff Ki,提供局部敏感性曲线与数据导出。
简单竞争抑制且无显著配体耗竭;不通用于所有 IC50。

结合标准自由能
ΔG°=RT ln(Kd/c°):根据输入计算结合标准自由能,提供局部敏感性曲线与数据导出。
以 c°=1 mol/L 构造无量纲平衡常数,标准态依赖约定。

能斯特电位
E=E°−RT lnQ/(nF):根据输入计算能斯特电位,提供局部敏感性曲线与数据导出。
按写定的还原反应计算,反应商用活度构成。

平衡常数温度修正
ln(K₂/K₁)=−ΔH/R(1/T₂−1/T₁):根据输入计算平衡常数温度修正,提供局部敏感性曲线与数据导出。
反应焓在温区内近似恒定,无量纲 K 采用同标准态。

稀溶液渗透压
π=iCRT:根据输入计算稀溶液渗透压,提供局部敏感性曲线与数据导出。
稀溶液近似;电解质因子需考虑实际非理想性。

酶比活力
SA=activity/protein:根据输入计算酶比活力,提供局部敏感性曲线与数据导出。
酶活单位依底物、温度和测定方法定义。

蛋白纯化倍数
fold=SAfinal/SAinitial:根据输入计算蛋白纯化倍数,提供局部敏感性曲线与数据导出。
两次活力测定必须使用可比条件;倍数不等于纯度百分比。
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